FreeBirdの最新版では、この動画のように開水路の任意の場所に構造物・障害物・壁などを配置し、さらに構造物には流れが通過できるカルバートを配置した場合の流れの計算が可能となりました。この結果、様々な境界条件のもとの３次元流れの解析が可能となりました。ぜひお試しください。この例のような複雑な境界条件の設定法はこちらをご覧ください。
https://i-ric.org/yasu/freebird/site/index.html